Andrej Naterer je zaposlen kot docent na Oddelku za sociologijo, Filozofske fakultete, Univerze v Mariboru. Primarno znanstveno raziskovalno polje, s katerim se ukvarja, je vezano na mlade, še posebej v povezavi z rizičnimi življenjskimi stili in socialno marginalizacijo.

Med študijem sociologije in filozofije na Univerzi v Mariboru se je začel ukvarjati s terenskim delom s področja socialne antropologije. Po opravljeni diplomi se je vpisal na doktorski študij antropologije na Fakulteti za družbene vede v Ljubljani, kjer je leta 2010 doktoriral. Od leta 2000 do 2012 je opravljal antropološko terensko delo med cestnimi otroci v Ukrajini, leta 2003 pa je opravil tudi dvomesečno antropološko terensko delo med cestnimi otroci v Indiji.

Je avtor znanstvene monografije Bomži, cestni otroci v Makejevki in urednik zbornika Subkulture.